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手把手教你使用TCGA下載臨床數(shù)據(jù)

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2021-01-20
如何下載臨床數(shù)據(jù)?相信這個問題一定困擾過做科研的你,下面跟小編一起來Get這個技能吧!

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1. 打開瀏覽器搜索“TCGA GDC



2. 鼠標(biāo)放置在 Repository”處就會看到出現(xiàn)“browse and download data”字樣,說明轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)是在這里下載的 


3. 進(jìn)入“Repository”后先看右上角“Cart”處是否為“0”,不為零的話要先清除之前下載的數(shù)據(jù),清除方法是選擇“Cart”,然后點(diǎn)擊右下角的“Remove From Cart”。

 

4. Cart”里面的內(nèi)容清除之后,點(diǎn)擊“Repository”,開始選擇需要下載的樣品信息“Cases”和需要下載的文件“Files”。

 

5. 這里我們以結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ為例,下載臨床信息,首先選擇樣品信息“Cases”,我們這里選擇的結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ的所有信息,如果需要下載針對性的臨床信息(這里我們選擇結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ的數(shù)據(jù)進(jìn)行下載)可以在下拉框中自行選擇





6. 然后選擇需要下載的文件“Files”,這里也可以再下拉框中根據(jù)自己需要的格式進(jìn)行下載

 

7. 然后將文件添加到“Cart, 即點(diǎn)擊“Add All Files to Cart

 

8. 總共篩選出548個結(jié)腸癌和直腸癌臨床數(shù)據(jù)的樣本信息,進(jìn)入“Cart”頁面,選擇要下載的格式進(jìn)行下載

 

這樣我們的臨床數(shù)據(jù)的樣本信息就下載完成了,小伙伴們?nèi)绻胍獙W(xué)習(xí)其他數(shù)據(jù)庫的使用,請持續(xù)關(guān)注呦!


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