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Cancer Driver Catalog:癌癥候選驅(qū)動(dòng)基因數(shù)據(jù)庫(kù)

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2022-07-27
該數(shù)據(jù)庫(kù)使用 PCAWG 和 TCGA 的數(shù)據(jù)集評(píng)估了 12 種驅(qū)動(dòng)基因計(jì)算方法的性能后,將基因、相應(yīng)的可能性分?jǐn)?shù)和基因在候選驅(qū)動(dòng)基因......


該數(shù)據(jù)庫(kù)使用 PCAWG TCGA 的數(shù)據(jù)集評(píng)估了 12 種驅(qū)動(dòng)基因計(jì)算方法的性能后,將基因、相應(yīng)的可能性分?jǐn)?shù)和基因在候選驅(qū)動(dòng)基因列表中的基因排名通過(guò) 12 種計(jì)算方法使用 6 個(gè)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析。基因的等級(jí)越高,就越有可能成為真正的癌癥驅(qū)動(dòng)因素。http://159.226.67.237/sun/cancer_driver/



數(shù)據(jù)庫(kù)頁(yè)面非常簡(jiǎn)潔,在主頁(yè)上進(jìn)行搜索、下載即可。

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選擇癌癥類(lèi)型、計(jì)算方法、網(wǎng)絡(luò)后,輸入感興趣的基因如“TP53”,點(diǎn)擊submit后將在下方顯示搜索結(jié)果。



點(diǎn)擊gene可以跳轉(zhuǎn)到該基因的NCBI頁(yè)面。搜索結(jié)果可以下載為excelcsv格式的文件。


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數(shù)據(jù)庫(kù)提供以上3類(lèi)數(shù)據(jù)的下載,點(diǎn)擊鏈接進(jìn)行保存即可。

 


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