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9分SCI文章——tRF高通量測(cè)序

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2020-03-04
近年來,非編碼RNA研究熱潮興起,隨著研究的不斷深入,非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高......

   近年來,非編碼RNA研究熱潮興起,隨著研究的不斷深入,非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高。然而,近日一篇測(cè)序?yàn)橹鞯姆蔷幋aRNA文章出現(xiàn)在了9分的雜志中。我們來看看是如何做到的吧:

   研究者的研究對(duì)象是非編碼RNA—tRF,一類相對(duì)來說少有研究的small RNA。研究者以tsRNA為切入點(diǎn),發(fā)現(xiàn)在慢性淋巴細(xì)胞性白血?。–LL)中tsRNA ts-43、ts-44相對(duì)于正常B細(xì)胞中下調(diào)了3-5倍,這兩個(gè)tsRNA均來自pre-tRNA His,而 tRNA His的tRF-5片段也顯著下調(diào)。因此,研究者對(duì)CLL中成熟tRF表達(dá)水平進(jìn)行了研究。
一、small RNA測(cè)序:研究侵襲性、惰性CLL中tsRNA
1.對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選出差異表達(dá)的tsRNA,結(jié)果如下圖所示:

2.q-PCR驗(yàn)證tsRNA在臨床樣本中的表達(dá)



二、ts-43、ts-44前體tRF-5表達(dá)下調(diào)


三、根據(jù)small RNA測(cè)序數(shù)據(jù),結(jié)合q-PCR分析成熟tRF表達(dá)情況
1.對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析:CLL tRF表達(dá)與正常B細(xì)胞的確存在差異

2.q-PCR在臨床樣本中進(jìn)行驗(yàn)證

   綜上,研究者得出結(jié)論:成熟的tRF可能在CLL中行使致癌/抑癌的功能。
   高通量測(cè)序、非編碼RNA的研究在如今的科研中已相對(duì)“尋?!?,但尋找一個(gè)相對(duì)較新的非編碼RNA分子(如tRF、snoRNA)仍有可能發(fā)高分文章。

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